南京市儿童医院创建于1953年4月，前身为南京方济各玛丽亚女修会1936年创办的圣心儿童院。现占地面积28086平方米，建筑面积44651平方米。1990年成为南京大学医学院教学医院，1997年被评为江苏省三级甲等儿童医院， 1999年成为南京医科大学附属医院，是一所集医疗、科研、教学、预防、康复于一体的综合性儿科医学基地。

    医院现有床位420张，临床医技科室35个，专业设置齐全，主要有儿内科（新生儿、呼吸、心内、肾脏、消化、内分沁科、神经内科、血液、中西医结合），儿外科（胸心外科、骨科、普外、脑外、烧伤整形、沁尿外科、新生儿外科），急诊科，门诊部（内、外科门诊，耳鼻咽喉科、眼科、口腔科、皮肤科、中医科、理疗科），儿保康复科，特需医疗服务部，麻醉手术科，药剂科，检验科，放射科，功能检查科，病理科等科室，并设有儿科研究所及呼吸、心血管、新生儿、临床药理研究室，其中省属重点学科3个，市属重点学科2个。2002年年门诊量85万人次，年收治住院病儿16300人次。

    医院现有职工915人，卫生专业技术人员696人，其中硕士生导师16名，高级职称以上专家93人，43人次在国家级和省级学术机构中任领导职务。拥有享受国务院特殊津贴专家1人，省"135"重点医学人才1名，省"333新世纪科学技术带头人培养工程"培养对象5名，市卫生局"213"人才梯队20名。

    50年的建设与发展，医院在医疗、科研和教学等方面取得了丰硕成果，形成了一批在全省以至全国处于先进水平的特色专科：省重点专科胸心外科，已开展体外循环心内直视手术近4000例，成功率达98%以上，尤以对低年龄组各类重症复杂先心病的诊断及手术矫治见长，手术患儿最小年龄仅5天。2000年该科在大量动物实验的基础上，成功施行了江苏省首例、全国第三例小儿同种异体原位心脏移植手术。省重点专科新生儿科对急危重症新生儿抢救成功率及对新生儿缺血缺氧性脑病的治疗、省重点专科呼吸科对小儿支气管哮喘的防治水平均处于省内领先地位。心内科、新生儿外科、骨科、普外科、急诊科、儿保康复科、药剂科等专科都有自己的特色和优势，如联体新生儿分离手术、新生儿心脏肿瘤手术矫治、腹腔镜下巨结肠根治术、先天性心脏病介入治疗、小儿脊柱侧弯的矫治、婴儿特种危重症的诊断、治疗和小儿多脏器功能衰竭的临床研究、新生儿早期干预康复治疗、小儿自制制剂的研究生产等都在省内外有较大影响。

    医院坚持"科技兴医"的战略，积极开展科研工作。5年以来，医院开展局以上科研课题73项，获省市各项成果奖27项，在各级专业杂志上发表学术论文760篇。

    医院拥有一批实力较强的师资队伍，设小儿内科、小儿外科、小儿传染3个教研室，承担南京医科大学、南京大学医学院等院校儿科理论教学任务，采用多媒体等现代化手段进行教学，收到良好的效果。每年接受实习、进修生200余人次，为社会培养了大量的儿科人才。

    医院还非常注重与世界各国的友好往来，先后与来自美国、加拿大、日本、德国、澳大利亚、斯洛伐克的同行进行学术交流与合作。1990年与加拿大西安大略省儿童医院结为姐妹医院。2001年9月，与美国国际儿童心脏病基金会联合成立了"南京中美儿童心脏病研究

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